| 表頭名稱 | 含義 |
| Accession | 蛋白質的登錄號，主要來源有Uniprot/NCBI |
| Description | 蛋白質在數據庫中的功能描述信息,包括蛋白名稱、物種名稱（OS=）、基因名稱（GN=） |
| Coverage | 覆蓋率（百分數），蛋白在質譜分析中鑒定到的氨基酸數目占蛋白組中得分最高的蛋白質總氨基酸數目的比例 |
| Score | 搜索結果的總和打分，該蛋白所鑒定到肽段的打分總和 |
| Peptides | 肽段數目，鑒定某蛋白質組的全部肽段數目，相當于用于定性的肽段數目 |
| PSMs | 二級肽段譜圖數，即可定性鑒定到多肽的二級肽段數目 |
| Unique Peptides | 唯一肽段數，專屬于某一蛋白質組的肽段數 |
| AAs | 氨基酸個數，蛋白序列長度 |
| Proteins | 蛋白組中所含有的蛋白數目 |
| MW[kDa] | 蛋白理論的分子量 |
| Calc.pl | 蛋白質的等電點 |
| 表頭名稱 | 含義 |
| Sequence | 多鑒定到多肽的序列 |
| Protein Groups | 蛋白組個數，即多肽出現在幾個蛋白組中 |
| Proteins | 蛋白個數，即多肽出現在幾個蛋白中 |
| Peptides | 肽段數目，鑒定某蛋白質組的全部肽段數目，相當于用于定性的肽段數目 |
| PSMs | 二級肽段譜圖數，即可定性鑒定到多肽的二級肽段數目 |
| Protein Group Accessions | 最佳的匹配蛋白組登錄 |
| Modifications | 肽段修飾類型 |
| MH+ [Da] | 肽段理論單電荷分子量 |
| q-value | 統計學計算，數值越小越好 |
| PEP | 后驗錯誤概率，數值越小越好 |
| 污染名稱 | 分子量 | 怎么避免污染 | 來源 |
| Keratin | 55KDa-60KDa | 保持實驗條件無塵，經常打掃保持衛生 | 來源于空氣、皮膚，甚至衣服 |
| PEG | 44Da | ? 通過SDS-PAGE膠可以去除樣本中大部分去除劑中的PEG污染 ? 所有試劑和耗材要是一次性最新的 | Triton X-100, Tween, NP-40等去污劑通常含有PEG成分 |
