近幾十年來，由于生物技術在識別和表征靶標和生產工業化數量的多肽和蛋白質方面的進步，基于蛋白質和多肽的生物治療，包括抗體-藥物偶聯物（ADC）和蛋白質/多肽半衰期延長平臺等非傳統方式，已經成為快速增長的藥物類別。除了作為生物治療藥物，蛋白質和多肽還可以作為診斷和指導疾病治療的生物標志物。為了支持生物醫學/藥物研究，特別是新開發的支架可能為治療疾病提供新的途徑，有很大的發展需求生物分析分析可靠地量化來自不同發現和發展研究的生物樣品中的這些大分子。
傳統上，配體結合分析（LBA），如酶聯免疫吸附分析（ELISA），一直是生物樣品中蛋白質和多肽定量的主要平臺。隨著質譜（MS）和樣品提取技術的進步，液相色譜-質譜（LC-MS）越來越多地被用作蛋白質和多肽生物分析的替代或補充技術。
LC-MS相對于LBA的主要優點是特異性高，方法開發時間短，能夠同時分析多個分析物，特別是早期藥物發現過程中，LBA的關鍵試劑不容易獲得時。還需要使用LC-MS來研究肽和蛋白質的體內命運（分解代謝），以協助穩定性評估和化合物優化。
Aimsmass目前能夠提供一種Middle Down分析策略. 這種方法不是將蛋白質作為小的替代肽或作為一個整體來分析，而是通過有限的酶消化和/或二硫鍵還原將分子分解成幾個大的片段。該方法從單克隆抗體中生成三種類型的片段，即輕鏈（Lc）、重鏈（Fd）的N端半段和?Fc，每個片段約25 kDa，作為完整單克隆抗體的定量替代品。小尺寸的碎片提供了潛在的檢測與提高靈敏度和分辨率。分析物的尺寸減小，Fc上糖基化引起的不均一性被消除，從而提高了靈敏度和檢測分辨率。
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