動物細胞基質通常用于生物制品的制造。因此，在生產過程中，來自細胞底物的微量/少量的 DNA，稱為殘留宿主細胞 DNA （rcDNA），可能會留在最終的制成品中。
病毒疫苗中與 rcDNA 相關的主要風險是傳染性和致癌性；如果存在逆轉錄病毒原病毒、DNA 病毒的整合副本或外染色體基因組，rcDNA 可能會傳播病毒感染；如果存在病毒或細胞底物（來自腫瘤或致瘤性）致癌基因，rcDNA 可能會帶來致癌的潛在風險。
盡管 rcDNA 測定可以在整個生產過程的不同階段使用適當的方法進行，但目前還沒有一種通用的方法來定量測定動物來源的 rcDNA。膜雜交和閾值法傳統上用于生物制藥中宿主rcDNA的定量。雜交方法在一些藥典文獻中仍有描述。
聚合酶鏈反應（PCR）的技術是很流行的檢測和定量 rcDNA 近年來，通常被認為是最實用和強大的常規方法 rcDNA 定量/序列特定物種，敏感，快速進行，適合高通量格式。此外，所需的設備和試劑可從多個供應商獲得。目標基因組區域的選擇對檢測結果有影響；選擇宿主基因組中多個拷貝中發現的目標DNA序列，將增加 rcDNA 被檢測和準確定量的可能性。
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