蛋白的高級結構是決定著其生物學功能，針對蛋白類藥物研究，全方位準確解析其高級結構是保證藥物安全的基礎。
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蛋白質高階結構(HOS)，是一種重要的產品質量屬性，決定著治療性蛋白的結構-功能特性、安全性和有效性，紅外光譜技術一直被認為是測定蛋白質二級結構和監測蛋白質動態結構變化的有力生物物理工具。
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氫氘交換質譜（HDX MS）技術主要是用來研究蛋白質空間構象，已被用于評估和開發單克隆抗體(mAB)、抗體-藥物偶聯物(ADC)和生物類似抗體。在制造和開發中，HDX-MS也可以驗證各種生物療法的存儲配方和制造工藝。
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糖基化修飾在眾多翻譯后修飾中屬于最常見的存在，在信號轉導及免疫反應中發揮著重要作用，適當的糖基化對藥代動力學至關重要，因此，糖基化檢測對于后續蛋白多肽類藥物功能研究具有重要作用。
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