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KD 穩定細胞系構建

大多數細胞生物學實驗使用短暫轉染方案,在轉染后的24-96小時內達到基因表達的峰值。然而,如果需要長時間持續的基因表達,構建穩定的細胞系是一個可行的選擇。此外,通過限制稀釋選擇的穩定細胞系提供了遺傳同質和克隆的細胞群體。

穩定細胞系的構建可以通過使用陽性選擇標記物(如 hygromycin、G418/Geneticin、zeocin 和 blasticidin 抗生素耐藥性)來實現。選擇標記物可以通過與目標基因在同一質粒上(cis 方式)或與含有目標基因的質粒共轉染(trans 方式)來傳遞。cis 方法通常較為簡單,并且更有可能產生抗藥性穩定轉染體,表達目標基因。當目標構建在質粒骨架中不含抗生素耐藥基因時,trans 共轉染方法是一個很好的選擇。在這種情況下,可以將含有5至10份基因表達質粒和1份抗生素選擇標記質粒的質?;旌衔镆爰毎?。這種質粒比例有助于確保所選細胞同時表達目標基因和選擇標記物。

在線咨詢

利用 CRISPR/Cas9 構建穩定敲除細胞系的步驟如下:

1. sgRNA 驗證:在實驗開始前,可以通過 sgRNA 在線驗證,篩選高效率的 sgRNA 用于敲除細胞系的構建。

2. 基因拷貝數:建議在開始實驗之前確定目標基因的拷貝數。

3. 質粒質量:使用高質量無內毒素的質粒 DNA。

4. 細胞條件:使用維護良好并經過常規認證的高質量細胞,包括檢測細菌,真菌或支原體污染。如果細胞來自新復蘇的細胞,則在使用前至少完成2次傳代。

5. 設計和合成 sgRNA 和基因型引物。

6. 用 Cas9 和 sgRNA 轉染細胞。

7. 使用適當的選擇標記篩選敲除細胞。

8. 單細胞克隆分離。

9. 使用 PCR 和測序篩選克隆以確認敲除。

10. 擴增陽性克隆。

11. 通過 Western 印跡或其他方法驗證敲除。

12. 檢測支原體污染并凍存穩定敲除細胞。

構建KD穩定細胞系的優勢:

  • 持續的基因沉默:穩定的敲低細胞系提供了長期和穩定的基因沉默,與瞬時敲低方法相比,可以持續較長時間的基因沉默[1]。這使得可以研究基因功能和通路信號在長時間內的作用。
  • 同質性和克隆性:通過有限稀釋法產生穩定的敲低細胞系,提供了基因同質和克隆的細胞群體。這確保了實驗結果的一致性和可重復性。
  • 減少變異:穩定的敲低細胞系克服了與瞬時轉染方法相關的變異問題;它們可以在較長的時間內保持靶基因的表達水平穩定,而不會有明顯的變化。
  • 實驗設計的靈活性:穩定的敲低細胞系可以被設計成加入額外的基因調控生物學機制,例如誘導化學或環境事件導致基因沉默。這使得能夠更精確地控制基因表達。
  • 多功能性:穩定的敲低細胞系可用于各種應用,包括基因功能研究、途徑分析、藥物篩選和重組蛋白質生產。它們為了解基因功能和研究基因沉默的影響提供了有價值的工具。

實驗流程

服務流程

  • 疑問咨詢
  • 項目確認
  • 提交送樣
  • 項目展開
  • 發生報告
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